无论是基本的擦洗或是彻底的清洁消毒，鱼缸的内外缸壁都不能使用尖锐的物品作为清洁用具，应该选择软性如毛巾、海棉等定期擦拭，以维持玻璃缸面的透亮。
方形或是长方形的鱼缸，其边角相连处会使用玻璃胶来封黏固定，但此玻璃胶不耐热，若是温度超过40度则黏胶会变软。黏胶变软会减轻耐拉强度，容易造成鱼缸破裂。玻璃胶的表面要时时注意有无刮伤，或是有裂开的痕迹，以避免漏水状况。清洗玻璃鱼缸时也要避免使用硷性的清洁剂，以免腐蚀玻璃胶。一般而言，玻璃胶若是保养得宜，寿命大约可达六年。
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