基因敲除技艺是人工地使靶基因的序列产生碱基对的填充、缺失或替代,惹起的靶基因构造的蜕化,以抵达定点粉饰改制特定基因的主意。基因敲除技艺是反向遗传学探索中最紧要的技艺器械。基因敲除斑马鱼渊博使用于遗传学、发育生物学、细胞生物学、医学、境遇毒理学、水产育种学等探索范围。
中央是我邦独一的邦度级斑马鱼资源平台,具有界限最大和规格最高的单体斑马鱼养殖体例和一支高本质的专业人才队列,保障以最高模范、最高质料和最高效果告终闭系技艺效劳。
目前,中央供应TALEN和CRISPR/cas9技艺介导的斑马鱼基因敲除技艺效劳。如您对条目性基因敲除(conditional knockout)或者基因精密粉饰感风趣,也迎接您与咱们举行周密疏导。
植物细菌Xanthomonas sp.的TAL卵白的核酸贯串域的氨基酸序列与其靶位点的核酸序列有恒定的对应联系。应用TAL的序列模块,可拼装成特异贯串任性DNA序列的模块化卵白,从而抵达靶向操作内源性基因的主意。该技艺开始必要修建针对任性特定核酸靶序列的重组核酸酶,正在特异的位点打断标的基因DNA,进而正在该位点举行DNA操作,如Knock-out、Knock-in或点突变。
中央修建了斑马鱼原始生殖细胞(PGC)高效、特异外达的TALEN平台,比拟通例的TALEN敲除平台,可特别高效地筛选得回TALEN敲除子代(异常是针对付效果较低的TALEN靶位而言)。
秩序成簇间隔短回文反复(CRISPR)是一类渊博分散于细菌基因组中的反复构造,经转录并加工成短的crRNA(CRISPR RNA)。crRNA通过碱基配对与tracrRNA(trans-activating RNA)贯串,造成双链RNA,指点内切酶Cas卵白(CRISPR-associated protein)正在crRNA序列靶标的特定位点剪切双链DNA。按照CRISPR-Cas体例的影响道理,可应用其举行真核生物基因组改制,即正在靶标DNA上实行特定位点的剪切,正在剪切后的修复进程中会引入靶向DNA序列的突变。该技艺中行使的gRNA(guide-RNA)是将crRNA和tracrRNA连绵起来动作指点RNA,Cas9卵白是type II CRISPR-Cas体例中的成员之一,具有HNH和RuvC-like两个核酸酶构造域,分辩剪切靶标DNA的互补链和非互补链。
中央修建了斑马鱼原始生殖细胞(PGC)高效、特异外达斑马鱼偏好暗码子Cas9(zCas9)的CRISPR/Cas9敲除平台,比拟通例的Cas9敲除平台,可特别高效地筛选得回Cas9敲除子代(异常是针对付效果较低的Cas9靶位而言);同时,中央也供应双缺口(double nicking)的Cas9基因敲除效劳,可能大大低落Cas9敲除的脱靶效应。
目前咱们供应AB配景的基因敲除斑马鱼制备,AB是最为广博行使的模范纯遗传配景之一,直接保障了委托方取得纯净配景的基因敲除斑马鱼。同时按照委托方的需求,咱们也供应TU以及其它遗传配景的基因敲除制备。
2. 平台告终由两边商议确定的技艺举行载体修建。搜罗制备TALEN序列识别模块(1周)或者合成gRNA(2-3天)。
4. 筛选出能转达主意基因敲除的P0代斑马鱼,与野生型斑马鱼杂交(或统一基因型P0代自交),筑筑F1代(5天)。
5. 将F1代突变斑马鱼提拔至2月龄(可能剪尾鳍举行逐尾判断),判断主意基因凯旋敲除的F1代并描写敲除的基因型,交付委托方(2个月)。
中央允许正在订立订交后140个任务日内,针对每个靶基因供应起码凯旋研制敲除品系 ≥2 尾PCR判断阳性的F1代斑马鱼(每个移码框突变阳性斑马鱼≥1 尾)和相应的侧交F2代胚胎(≥100枚)。
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